Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms