Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms