Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca4Q3TKT4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms