Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms