Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms