Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem248Q3TBN1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem248Q3TBN1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms