Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M3Q31093 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms