Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms