Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam178bQ24JP3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms