Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Teddm2Q208S0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Teddm2Q208S0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms