Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm1123Q1RME4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms