Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo3bQ1EG27 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms