Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam47cQ14BE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam47cQ14BE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms