Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tigd2Q0VBL1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms