Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Cntnap5cQ0V8T7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Cntnap5cQ0V8T7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Cntnap5cQ0V8T7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Cntnap5cQ0V8T7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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