Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Spata18Q0P557 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata18Q0P557 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms