Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrioQ0KL02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms