Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pate4Q09098 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate4Q09098 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate4Q09098 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pate4Q09098 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate4Q09098 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate4Q09098 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate4Q09098 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate4Q09098 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate4Q09098 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms