Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700061G19RikQ08EE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms