Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm3Q08189 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms