Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms