Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cab39Q06138 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms