Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPINDOCQ05AH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SPINDOCQ05AH6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms