Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms