Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rcn1Q05186 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms