Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms