Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms