Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scg2Q03517 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms