Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms