Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Epha4Q03137 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms