Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RykQ01887 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RykQ01887 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RykQ01887 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RykQ01887 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RykQ01887 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RykQ01887 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RykQ01887 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RykQ01887 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms