Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EgfrQ01279 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms