Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms