Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms