Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms