Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2cP97760 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms