Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad4P97471 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad4P97471 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms