Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms