Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms