Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhodP97348 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhodP97348 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhodP97348 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhodP97348 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhodP97348 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms