Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-3P97334 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-3P97334 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms