Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf1P84078 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf1P84078 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms