Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nucb2P81117 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms