Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb2P81069 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb2P81069 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms