Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx3P81067 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx3P81067 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx3P81067 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms