Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfi1P70338 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms