Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stra8P70278 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms