Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NficP70255 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NficP70255 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NficP70255 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NficP70255 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NficP70255 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NficP70255 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NficP70255 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NficP70255 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms