Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chl1P70232 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chl1P70232 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms