Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx1P63013 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms